始建于1986年的连云港市妇幼保健院，是一所集保健、医疗、教学、科研为一体的三级甲等妇幼保健院，扬州大学医学院附属连云港市妇幼保健院，徐州医学院教学妇幼保健院，市中医药高职校、淮安卫校、赣州卫校实习基地。占地面积28亩，建筑面积2.6万平方米，拥有床位369张，全院在职职工618名，其中卫技人员500余名，高级职称93名，中级职称161名，硕士以上研究生人员47余名，省市重点人才30余名。2013年，实现业务收入1.8亿元，门急诊45万人次，出院1.6万人次，手术7496台次，分娩数6564例。其中分娩数在市直医院遥遥领先。 该院开设十个病区，一个训练中心，拥有16排螺旋CT、基因分析仪、荧光定量PCR、串联质谱仪、数台三维、四维彩超、乳管镜、乳腺旋切系统、乳腺血氧功能成像系统、CPAP、钼耙机、干化学分析仪、三晶片腹腔镜、一体化产床、产科中央监护系统等大型精良设备。1994年被国家卫生部授予“爱婴医院”称号，先后荣获国家级敬老文明号、省文明单位、省平安医院、市政府颁发的母婴安康工程、消防工作、社会保险工作先进集体、市卫生事业发展综合目标考评一等奖、省价格诚信单位、省计量工作先进集体、全国巾帼文明示范岗、江苏省五四红旗团支部标兵，多次荣获市文明单位、市卫生事业发展综合目标考评二等奖，该院同时还是江苏省新生儿疾病筛查中心连云港分中心、连云港市产前诊断筛查中心、港城唯一一家人类辅助生殖、夫精人工授精技术临床专科医院。 近年来，人才、科教研工作实现历史性突破。顾莹入选市卫生系统唯一领军人才和省妇幼重点人才，汤丽莎入选省市共建人才（卫生系统仅2名），骆秀翠入选省妇幼重点人才，闫冬梅入选省妇幼重点人才培养对象。2013年，获批省级科研课题3项，局级3项，市新技术引进奖三等奖1项，市青年科技奖提名奖1项，全年共发表论文96篇，其中SCI 2 篇，中华系列期刊1篇，核心期刊15篇，完成省级继续教育项目2项，市级继续教育项目9项。 该院主要开展群体保健、妇女保健、儿童保健、母婴保健技术培训、指导、适宜新技术推广、妇女儿童常见病诊治、产前筛查、产前诊断、新生儿疾病筛查、听力筛查、产科并发症处理、新生儿危重症抢救和治疗等业务。产前诊断中心、孕产妇和婴儿死亡综合干预项目、儿童哮喘防治中心被评为省妇幼重点学科,辅助生殖医学中心、新生儿医学中心被评为省妇幼重点学科建设单位，产前诊断与遗传性疾病诊疗中心被连云港市卫生局评定为市级十大诊疗中心之一。妇产科、新生儿科、儿保科、群保科、生殖健康与不孕症科、儿童康复科为市重点学（专）科，其中妇产科被评为市优秀重点学科。 群体保健科，省妇幼重点学科，该科以妇幼保健技术研究和政策研究为手段，以全面提高妇女儿童的健康水平为目的，指导全市妇幼保健技术服务的开展。主要负责对全市妇幼卫生工作的业务指导、培训及咨询；开展适宜新技术推广；对全市妇幼卫生信息的收集、整理、分析和反馈以及妇幼卫生信息系统的建设与管理工作；开展妇幼保健健康教育活动；协助卫生行政部门制定妇幼保健发展规划。2013年，实现两癌普查70000人次，全市新生儿筛查率、听力筛查率均达99%以上。
