重庆市中山医院是由创建于1935年的义林医院、解放后改建的重庆市第二人民医院、1961年成立的重庆市外科医院演变发展而来。2001年，经市相关部门批准，正式更名为中山医院。经过七十多年的发展建设和全院职工的共同努力，凭借艰苦奋斗、团结协作的优良传统和“素质、责任、务实、创新”的时代精神，中山医院的发展进入了快速发展。
作为重庆市“十大公共医疗卫生建设项目”之一，2012年3月16日，市中山医院与市肺科医院正式合并为新重庆市中山医院。原市中山医院即为新中山医院渝中院区，原肺科医院即为新中山医院江北院区。
重庆市中山医院技术力量雄厚，专业配套齐全，设备先进，医疗条件好，擅长处理外科、内科各专业的各类疑难重症及各种创伤和复合创伤等病人。在各科和内外科联合救治和严密监护治疗的良好条件下，医疗效果显著，是重庆市卫生局直属集科研、教学、医疗一体的有较强综合实力的三级专科医院。
全院共设置病床700张，开放床位1000张。现有在编职工960人，其中专业技术人员750人，高级职称230人，中级职称310人；博士研究生32名，硕士研究生125名。医院有荣获国务院政府特殊津贴和国家级有突出贡献的中青年专家5人。临床科室有心血管外科，小儿心脏外科、心脏介入治疗科、胸外科、普外科、肝胆外科、神经外科、泌尿外科、骨伤骨病科、心血管内科、呼吸内科、神经内科、消化内科、肾内科、内分泌科、肿瘤科、肿瘤放射治疗科、血液病科、中医科、眼科、耳鼻喉科、妇科、皮肤性病科、理疗康复科、医学美容科、急诊科、手术室、麻醉科、重症监护病房、血液透析室等。并设有心脏血管疾病和骨伤骨病相关研究室共5个。其中心血管外科与骨伤骨病科是重庆市医学重点学科，重症医学科荣获重庆市首批临床重点专科。
