感染病科在乙脑、流脑的治疗和抢救成功率方面居全国先进地位。对霍乱、伤寒、菌痢等肠道传染病的抢救和治疗，动物咬伤及狂犬病的预防，麻疹、风疹等发疹性传染病及其并发症的诊治，婴儿百日咳的抢救，对流行性腮腺炎并发症的诊治，流行性出血热合并急性肾功能衰竭的抢救，AIDS的抗病毒治疗及其机会性感染机会性肿瘤的诊疗等，均在省内处于领先地位。科室现有医生11人，包括主任医师2人，副主任医师2人，主治医师1人，拥有博士学位1人、硕士9人。我们的服务理念是以病人为中心，把社会效益和群众利益放在首位，把患者的满意度作为衡量服务质量的标尺，让每一个病人得到满意的服务。

       本学科主要的科学贡献：南京市第二医院感染病科是江苏省"135"重点学科合作单位重要组成，江苏省传染病诊疗技术中心、江苏省传染科质量控制中心以及江苏省重点临床专科重要组成，南京市重点专科，为南京市收治急慢性传染病的主要科室。承担国家科技专项、省市级课题多项，参编《传染科主治医师手册》《医疗机构医务人员三基训练习题集》《医疗机构医务人员三基训练指南》《小儿感染病学》、《实用全科医师指南》等。
        本学科主要的社会服务贡献：（1）学科年门诊量6000人次 ，年平均住院1200人次。（2）承担南京地区各级医院（包括省、市、部队医院），以及省内外医院急慢性传染病的会诊工作，目前每年会诊任务百余次。（3）接受省内外专科医师进修，承担东南大学医学院、南京大学医学院、第二军医大学、南方医科大学、南京中医药大学等"传染病学"教学任务。 获奖情况：感染病科近年获得多项科研成果，包括江苏省卫生厅新技术引进一等奖2项、二等奖1项，南京市科技进步三等奖2项；通过市科技局鉴定课题1项；在研课题有省科技厅立项课题、市科技局立项课题等数项。在SCI、中华级、核心和统计源期刊上发表论文百余篇。