擅长手术治疗肺癌、食管癌、纵隔肿瘤、肺结核病、小儿先天性肺、食管疾病、漏斗胸、手汗症、严重胸外伤。创立和实施了一整套损伤轻、代价小、康复快、并发症少的有效方法，并创造了数十项全市、乃至全国的第一。主持国家级、省市级科研课题约10项，发表学术论文70余篇。获得广东省科技进步一等奖、深圳市科技进步二、三等奖各一项。
王正主任是国内著名胸外科专家。1994年开始进行微创胸外科研究，是中国最早倡导和积极实施微创胸外科和多学科会诊制度理念的胸外科专家之一。1996年担任胸外科主任后，便开始全力推行以电视胸腔镜技术为核心的微创胸外科。
已主持和主刀完成了各种复杂困难的肺癌、食管癌、纵隔肿瘤、肺结核及严重肺气肿等胸心外科手术10000余例，许多难治的恶性肿瘤病人长期生存了10年、15年、甚至20余年。其诊治的病人年龄范围从出生几天的新生儿到年逾九旬的耄耄老者。1998年开始开展单操作孔全胸腔镜肺叶切除术，2012年开始做单孔胸腔镜手术。
