小肠是消化道中间部分，食物经食管进入胃内，食物所携带病菌在胃酸PH 1-1.5环境中被灭菌，十二指肠、空肠内菌落计数<100-4 CFU/ml，为少量革兰氏阳性需氧菌，如：乳酸杆菌、肠球菌，空回肠交界处菌量<100-5CFU/ml，更加接近结肠的下段小肠-回肠内菌量增加至<105-8 CFU/ml，与回肠隔着回盲瓣的结肠的菌量增加至<1010-12 CFU/ml，并以厌氧菌为主。小肠细菌过度生长的菌量诊断标准目前还不统一，从>105 CFU/ml到1010CFU/ml不等。检查方法有小肠液培养和呼气试验（葡萄糖氢呼气试验和乳果糖氢呼气试验），但存在侵入性和敏感性、特异性不高等不足，未广泛开展。进入消化道的碳水化合物大部分经胰淀粉酶及小肠绒毛的双糖酶消化，在空肠基本被吸收。肠道气体是不被小肠消化和吸收的碳水化合物到达结肠，被结肠细菌酵解产生，碳水化合物是否能被酵解与肠道细菌的量有关，小肠内的细菌量不足以酵解碳水化合物产生气体，当小肠内细菌过度生长达到一定量就可以酵解碳水化合物产生气体，导致腹胀、肠鸣，同时细菌导致小肠绒毛细胞炎症，影响吸收，导致腹泻、消瘦、无力。小肠细菌过度生长由于症状不具有特异性和临床表现隐匿常被忽视而存在多年，或长期诊断为“功能性胃肠道疾病”、“肠道菌群失调”，但消化酶、益生菌不能改善。目前临床用于诊断小肠细菌过度生长的方法[1]为氢呼气试验，但由于受到肠道蠕动快慢等因素干扰，准确性和特异性不是十分理想。临床诊断小肠细菌过度生长的依据考虑：1.诱发小肠细菌过度生长的因素，如：抗生素的应用、PPI长期应用、放疗化疗等。2.腹胀、肠鸣、腹泻伴消瘦无力。3.肠道菌群分类比例正常。4.腹部CT或平片提示积气或梗阻位于小肠。5. 消化酶、益生菌治疗3个月无效。如符合上述标准可考虑“小肠细菌过度生长”可能，给予试验性治疗。小肠细菌过度生长的治疗，症状轻微可通过要素饮食和西甲硅油治疗。要素饮食中糖类为糊精（2-10个葡萄糖聚合物），进入小肠很快被消化葡萄糖在近端空肠吸收，小肠细菌失去酵解底物，生长被抑制。西甲硅油暨聚二甲基硅氧烷，改变消化道中存在于食糜和黏液内的气泡的表面张力，使气泡分解，释放出的气体可以被肠壁吸收或通过肠蠕动排出体外。症状重者需要抗菌素，国外常用利福昔明，利福昔明对需氧菌、厌氧菌、革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌均有效，且不被消化道吸收。研究发现肠易激综合征患者，无论便秘型还是腹泻型，都存在腹胀表现，肠道内气体增加主要位于小肠，提示存在小肠细菌过度生长。小肠细菌酵解碳水化合物产生的氢气进入结肠，被甲烷和硫酸盐还原细菌作用产生CH4和H2S，CH4降低餐后血浆血清素-蠕动反射中介的水平，减缓肠道运输，导致IBS-C。H2S增加肠道蠕动，导致IBS-D，H2S可作为IBS-D的生物学标记物。甲烷和硫酸盐还原细菌在结肠中高度竞争，IBS患者排出的肠道气体应以CH4或H2S一种为主。小肠细菌过度生长因症状隐匿，检查仪器非医院常规设备，发病率在临床被低估，试验性治疗方法简单，既是治疗也是诊断方法。