男人是半边天，在生育过程中男性提供了遗传学的一半的载体，所以在妊娠结局中也有着非常重要的地位。染色体是基因的载体，染色体异常是导致男性不育、流产和胎停育的重要因素。妊娠失败的男性因素还包括精子DNA损伤、表观遗传学及修饰异常、高龄、不良的生活习惯等。
1.染色体异常 分为染色体数目异常和结构异常，数目异常包括整倍体和非整倍体异常，结构异常包括重复、缺失、易位、倒位、插入等。
受精卵染色体：精子染色体+卵子染色体，一般在妊娠早期即表现发育失败；
胚胎染色体：受精卵卵裂后的染色体，多数在妊娠中、早期即终止发育，少数情况可以延续到妊娠后期、或获得出生。
2. Y染色体微缺失 AZFa区缺失表现为无精子症，病理表现为唯支持细胞综合征（SCOS），是真的没有精子、巧妇难为无米之炊。AZFb区缺失精子发生阻滞在精母细胞阶段，无精子症。AZFc区缺失可表现为生精正常或不同程度的生精障碍。AZFc缺失可能导致性染色体不稳定，在减数分裂时部分或全部丢失而导致胎停育或流产发生。
3. 染色体多态性 1、9、16号染色体次级缢痕的增长或缩短，9号染色体臂间倒位、大Y（大于18号染色体）或小Y（小于1/2G组染色体）、近端着丝粒染色体随体的大小和有无等均被视为多态性。9号染色体倒位靠近着丝粒，多属于多态性，远离着丝粒，影响功能基因，则不属于多态；小Y如合并AZF片段缺失，则不认为是多态。非多态性的变化则可能导致妊娠失败、或不育、或有遗传风险。
4. 基因突变 点突变、移码突变、动态突变，错义突变是碱基替换导致改变的密码子编码另一种氨基酸，使多肽中的氨基酸种类和序列发生改变，产生异常的蛋白质分子，影响蛋白质的功能；无义突变：碱基替换使原来编码氨基酸的密码子变成终止密码子，肽链合成提前终止，无义突变常产生较明显的表型，通常是致病性突变。AURKC（aurora kinase C） 突变是导致大头精子畸形；DPY19L2、 ZPBP、 PICK1和 SPATA16基因突变精子呈圆头。这类变化或使精子失去自然授精能力。
5. 表观遗传或修饰异常 DNA甲基化、组蛋白修饰、定向组蛋白保留以及鱼精蛋白整合入核染色质，对精子发育有重要影响，精子除输送染色体外，还包括卵母细胞活化因子、中心体（细胞分裂必需）及受精卵发育必需的多种mRNA。这类变化是胎停、自然流产的主要原因之一。
6. 精子DNA损伤重 成熟精子缺乏胞浆，没有自我修复能力，但成熟的卵细胞具有良好的DNA修复功能，损伤轻微修复完善可以继续妊娠，如精子DNA损伤严重，则可能发生胎停育或流产，包括精索静脉曲张、化疗及放疗、吸烟、ROS及白细胞精子症、凋亡异常、鱼精蛋白缺乏等。
7. 高龄 男性＞40岁，女性＞35岁，配子老化，凋亡率增加，异常配子概率较高，也是流产和胎停育的重要因素。
8. 不良生活习惯 吸烟酗酒、高温暴晒、熬夜、过度劳累、电磁辐射等都会影响生殖健康，从而导致妊娠失败。
9. 内分泌异常 性腺、甲状腺和肾上腺功能异常影响激素水平，如睾酮缺乏、雌激素过高等导致妊娠失败。
10. 感染因素 衣原体、支原体、巨细胞病毒、风疹病毒、腺病毒等感染可能影响妊娠结局。
