1.包皮过长容易使包皮垢聚集堆积引发包皮炎甚至包皮龟头炎。
2.研究发现，包皮垢是一种致癌物质，可能导致阴茎癌
3.性交时，过长的包皮易导致包皮垢混入精液中，降低精液质量，甚至造成不育。
4.包皮过长在平时使得龟头缺少刺激，可能导致男性婚后出现早泄、阳痿等症状。
5.包皮过长引起尿道狭窄，当内压过大时，尿液逆流，可能会损害肾脏功能。
6.包皮垢易进入伴侣阴道之中，诱发官颈糜烂甚至是官颈癌。
高促性腺激素性性腺机能低下症，病变在睾丸。由于睾丸有问题，不能接受促性腺激素的指令，所以不能正常生产睾丸酮，出现阴茎不发育或发育不全等情况，从而导致阴茎短小。
很多资料表明，小阴茎患者体内睾丸酮水平远远低于正常人。有些患者睾丸功能虽然正常，但接受不到来自下丘脑或脑腺体促性腺激素的指令，照样不会分泌睾丸酮。在青春期任何造成雄激素合成和分泌障碍的因素，都可能影响阴茎的发育，形成阴茎短小。青春期后，阻茎的结构和功能的维持仍有赖于雄激素。
