1.一级预防  一级预防是针对病因或者影响因素采取的措施。疫苗接种作为一种预防衣原体感染的措施，可以在有效预防和控制衣原体感染的传播和流行上发挥重要作用。长期以来，众多学者已从多种技术路径方面开展了衣原体疫苗的研发，但至今仍无商品化提供的疫苗问世。预防衣原体感染需要通过健康教育建立健康行为。对衣原体感染及其危害的了解是引导人们建立衣原体感染防治健康行为的基础。然而，目前我国的部分人群对衣原体感染的知识尚不了解。一项在性病门诊就诊者中开展的调查发现，该人群的衣原体感染知晓率只有27%。因此，迫切需要加强衣原体感染相关健康知识的宣传教育，普及衣原体感染的防治知识，提高风险意识和自我防护能力，避免和减少危险行为，同时提高感染风险者的就医意识。

2.二级预防  二级预防是指早发现、早诊断、早治疗。针对目标人群开展衣原体的筛查已经成为许多国家衣原体感染防治的关键策略。英国2002年启动全国衣原体筛查项目（National Chlamydia Screening Programme，NCSP），为25岁以下的性活跃者提供机会性筛查，旨在早期发现和治疗无症状感染者。美国CDC建议对所有年龄＜25岁的性活跃女性进行年度筛查，对高感染风险（如有新性伴或多性伴、伴侣同时有性伴或有性病感染性伴侣）的年长女性进行筛查。我国2016年启动了全国生殖道衣原体感染综合防治试点项目，先后在广东省、浙江省、江苏省、上海市开展试点工作，探索防治模式和创新策略，以便在全国范围内推广实施。目前临床上常用的诊断方法包括抗原检测和核酸检测。抗原检测最常用的为免疫层析法，一般采用子宫颈拭子，该方法对样本保存条件要求不高，检测周期相对较短，因此在基层医疗机构广泛使用。但抗原检测的灵敏度仅为17%~87%，特异度为89%~100%，易造成漏诊。核酸扩增技术（nucleic acid amplification techniques，NAATs）的敏感度和特异度非常高，是首选的诊断技术。NAATs方法对生物样本要求不高，对首段尿、阴道和子宫颈拭子均可进行有效的检测。衣原体感染的治疗方式主要是以抗生素为主，如多西环素、阿奇霉素等。但多项研究结果显示，多西环素和阿奇霉素口服治疗衣原体感染的疗效是有差异的。Meta 分析结果显示，多西环素治疗泌尿生殖道衣原体感染的治愈率为98%，阿奇霉素为90%。2024年《中国沙眼衣原体泌尿生殖道感染临床诊疗指南》中成人衣原体感染推荐治疗方案：多西环素100 mg，每日2次，连续7 d；替代方案：第1天口服阿奇霉素1 g，第2天和第3天0.5 g；或口服四环素500 mg，每日4次，连续7 d；或口服红霉素500 mg，每日4次，连续7 d；或口服氧氟沙星200~400 mg，每日2次，连续7 d。对妊娠期Ct感染者，指南推荐方案为：阿奇霉素1g单剂量口服；替代方案：口服阿莫西林500 mg，每日3次，连续7 d；口服红霉素500 mg，每日4次，连续7 d。多西环素会引起胎儿牙齿变色、牙釉质再生不良以及抑制胎儿骨骼生长，因此在妊娠期禁用。

3.三级预防  三级预防是指对已经患病者做好积极治疗以及定期随访等工作。指南建议有下列情况时考虑做微生物学随访：（1）症状持续存在。（2）怀疑再感染。（3）怀疑未依从治疗。（4）无症状感染。（5）红霉素治疗后。微生物学随访时间：抗原检测实验为疗程结束后的2周；核酸扩增实验为疗程结束后的4周。对于女性患者，建议在治疗后3~4个月再次进行检测，以发现可能的再感染，防止盆腔炎性疾病或其他并发症的发生。对于复杂衣原体生殖道感染的随访，在关注患者主观和客观症状的同时，需要连续的病原学检测：疗程结束后在第1、2、3个月做3次可靠的实验室检测（核酸、细胞培养或抗原检测），阴性可判为治愈。