1.抗病毒药
相对安全药物：乙肝患者备孕，替诺福韦酯是安全性较高的B类药物。
慎用及禁用：拉米夫定、阿德福韦酯和恩替卡韦都被看作是C类，并且有潜在致畸性；干扰素孕妇应禁止使用。也有观点建议若怀孕前仍在继续行抗病毒治疗，则怀孕时可能不需要停药；利巴韦林（X类，“病毒唑”)有致畸作用，停药后的六个月内应避孕。
2.抗生素 ：
相对安全药物：头孢类药物与青霉素安全有效，警示：按推荐剂量使用，不可超量；红霉素、罗红霉素是衣原体、支原体感染首选药，青霉素过敏者可使用；
慎用及禁用：复方新诺明可引起新生儿黄痘，拮抗叶酸；四环素（D类）类抗生素妊娠15周后禁用，特别是妊娠中晚期使用导致乳牙永久性变色和胎儿长管状骨暂时性生长抑制；喹诺酮类药物（C类）孕早期使用可能会增加骨畸形的风险，目前没有相关报道，妊娠期慎用；氨基糖苷类抗生素（链霉素、庆大霉素、卡那霉素）有耳神经毒性。氯霉素和甲砜霉素可导致灰婴综合征，整个孕期禁用；呋喃妥因（B类药物）可引起溶血，应慎用；克霉唑、制霉菌素、灰黄霉素孕妇最好不用；甲硝唑治疗滴虫感染，早孕期不建议使用；螺旋霉素治疗弓形体感染，无致畸性；磺胺类不在临近分娩时使用可能造成新生儿黄疸。
3.疫苗
在怀孕期间，孕妇应尽量不接种疫苗。孕妇不宜接种活疫苗（麻疹、风疹、水痘、卡介苗、口服脊髓灰质炎疫苗等）。但甲型H1N1流感疫苗妊娠各期均可接种。高危人群或紧急情况（动物咬抓伤需及时注射狂犬疫苗），需要接种疫苗。
4. 解热镇痛药
相对安全药物： 对乙酰氨基酚多数感冒药中都含有它，相对安全。但也有研究表明孕妇长期服用可能会升高婴儿在幼年时患有儿童多动症的比例。 较为安全的治疗感冒药物：如发热超过38.5度，必要时可使用对乙酰氨基酚片。如果存在上呼吸道感染，可以使用阿莫西林或第一二代头孢，青霉素类过敏患者可使用阿奇霉素。
慎用及禁用：孕期应避免使用含“胺”“麻”等字眼（“美敏伪麻溶液”、“氨酚烷胺胶囊”）要避免使用，胺，指的是金刚烷胺，麻，指的是伪麻黄碱。含可待因或罂粟壳或桔梗的产品（强力枇杷露）应避免使用；单纯止痛，孕3个月内孕妇不应服用阿司匹林和布洛芬、萘普生等非甾体抗炎药。扑热息痛可产生肝脏毒性。阿斯匹林可伴有羊水过少，胎儿动脉导管过早关闭。布洛芬、奈普生、吲哚美辛可引起胎儿动脉导管收缩导致肺动脉高压及羊水过少、妊娠 34 周后不宜应用消炎痛，可引起胎儿脑室内出血、肺支气管发育不良及坏死性小肠结肠炎等不良作用。
5. 避孕药及激素类药物：
避孕药的致畸性至今意见不一。
提示慎用及禁用的研究：口服避孕药后至少要停药3个月后再怀孕为宜，若能停半年，则更好。 避孕药避孕失败而怀孕，或停服避孕药后马上怀孕会引起胎儿脊柱、肛门、心脏、气管食道、肾脏和四肢畸形。避孕药大多数含有孕激素和少量的雌激素，可能会使女性胎儿男性化及胎儿出生后阴道癌发病率增加。米非司酮是杀胚药物，妊娠期禁用。己烯雌酚备孕期妇女应该远离。 可的松、肾上腺皮质激素、胰岛素等均可能导致胎儿兔唇、腭裂、无脑儿、脑积水等畸形。
提示相对安全的研究：英国皇家医师协会将5000名在怀孕前或怀孕早期曾经用过口服避孕药的孕妇和10000名未服过避孕药的孕妇作了对照观察后发现，其并不引起胎儿畸形。
6. 心血管系统药：
慎用及禁用：华法林钠可引起鼻发育不全、软骨发育异常、中枢神经系统发育异常。阿托伐他汀、氟伐他汀、辛伐他汀等有脑畸形、肢体缺损现象报道。血管紧张素转化酶抑制剂（ACEI：卡托普利、贝那普利、福辛普利等）或沙坦类（ARB：氯沙坦、厄贝沙坦、缬沙坦、替米沙坦）可导致胎盘循环量减少，胎儿低血压、羊水过少、呼吸窘迫、无尿、肾衰竭等症状，妊娠期禁止使用；β受体阻断剂有引起胎儿生长迟缓的报道；利尿剂近足月给药可引起新生儿血小板减少应慎用。
相对安全：地高辛对胎儿无明显不良作用，心衰孕妇可使用
7.抗癫痫、抗精神病药及镇静药：
慎用及禁用：丙戊酸、托吡酯、苯巴比妥、苯妥因钠、卡马西平等有致畸作用，其中丙戊酸钠发现风险最高。抗精神病药均有致畸作用。 镇静药物：如安定，舒乐安定，个别有致畸作用。
8.自身免疫疾病相关药物：
慎用及禁用：吗替麦考酚酯（MMF）和甲氨蝶呤（MTX）增加自然流产和出生缺陷发生率，孕期禁用。来氟米特可引起无眼或微眼、梗阻性脑积水。硫唑嘌呤、环孢霉素对母儿有明显毒性。环磷酰胺具有致畸性和生殖毒性 。
9.中草药
忌用或慎用：活血化瘀药物:川芎、丹参、桃仁、红花、泽兰、马鞭草、乳香、郁金、延胡索、姜黄、降香等。毒性药物:半夏、蜈蚣、辰砂。
10. 皮肤科及抗组胺药：
异维A酸有效治疗痤疮（俗称痘痘）是除沙利度胺以来最强的致畸性药物，从体内完全清除大约需要6个月，备孕期和妊娠期禁用异维A酸。
依曲替酯(芳香维甲酸)：治疗牛皮癣，至少停药 2 年以上才可受孕。
11. 维生素类：
相对安全：孕早期缺乏叶酸会影响神经系统的发育，备孕的女性以及早孕3个月内的孕妇每天至少补充400微克的叶酸。如果妊娠期需要使用维生素K应用维生素K1。
忌用或慎用：维生素K3 临近分娩使用会引起新生儿显著的高胆红素血症和核黄疸。
12. 治疗哮喘药物及消化系统用药：
相对安全：茶碱、肾上腺素、色甘酸钠、强的松等均无致畸作用。
忌用或慎用：应避免使用各种含有铋和碱式水杨酸盐的抗酸剂； 减肥药可造成胎儿无脑畸形。
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13. 饮食及不良嗜好：
茶叶易造成胎儿缺铁性贫血；孕期内抽烟的妇女，早期流产、婴儿体重较轻、新生儿死亡、胎盘早期剥离、婴儿畸形发生率显著增加；酗酒导致胎儿产生酒精中毒症状，包括：生长发育迟缓、智力发育不足、行为偏差以及特殊的脸部外观、心脏、脑部发育畸形。
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