临床上对于巧克力囊肿的治疗分为药物治疗和手术治疗两大类，我们会根据病人年龄、疾病严重度或有无生育计划等情况来选择适当的治疗方式。

基于以往大量的研究数据，我们认为：

1.当患者超声图像提示为典型的内异症且未经正规药物治疗时

如果患者年龄≤40岁且囊肿≤5厘米时，可以尝试采用药物保守治疗并定期随访检查。当药物治疗无法控制疼痛症状，或者囊肿持续变大，或者超声特征变得可疑，可以考虑手术，选择腹腔镜微创手术。

2.对于造成不孕的巧克力囊肿

腹腔镜手术可以提高患者的生育机会，但如果不孕问题在手术后仍无法解决，可能需要借助辅助生育技术完成生育。

3.如果囊肿＞5cm

即便没有疼痛或者不孕症状，如果经过充分的观察和药物治疗，排除生理性囊肿和炎性肿块后，囊肿不缩小可以考虑进行手术。当然，具体需要结合患者的年龄、生育需求和卵巢储备能力来综合考虑。

另外要提醒的是，比囊肿直径更重要的一个影响手术的因素是：囊肿的生长速度。建议患者每3-6个月复查一次超声，了解囊肿的生长速度，如果囊肿生长较快，可能需要考虑手术。

如果巧克力囊肿手术时，生育指数评分（EFI）较高，说明患者自然受孕机会较大，那么，术后患者可抓紧时间进行试孕；即使患者自然受孕机会很低，也需要积极采用辅助生育手段来帮助怀孕。因为怀孕以后，加上产后哺乳的时间，患者大约有1-2年的时间不来月经，自然而然地，巧克力囊肿的复发时间会相应顺延，甚至微小的病灶被孕期高水平的孕激素抑制之后有可能不再生长