真菌可通过呼吸道、消化道、各种插管、皮肤破损处等途径感染人体，当人体抵抗力低下时，就可能罹患真菌类疾病，比如皮肤癣菌病(手癣、足癣体癣)、念珠菌病、曲霉病、肺部真菌感染、隐球菌病等。目前常见的真菌有念珠菌、曲霉菌、毛霉菌、奴卡菌、隐球菌、放线菌等，此外，还有新发现的一些真菌，比如赛多孢菌属、镰孢霉属、副球孢子菌、球孢子菌、芽生菌。真菌感染性疾病根据真菌侵犯人体的部位分为4类：浅表真菌病、皮肤真菌病、皮下组织真菌病和系统性真菌病；前二者合称为浅部真菌病，后二者又称为深部真菌病