目前尚无临床数据支持九价HPV疫苗与其他HPV疫苗互换使用。世界卫生组织关于HPV疫苗立场文件，对三种疫苗推荐没有偏好。从公共卫生角度而言，二价、四价和九价疫苗在预防宫颈癌（主要由HPV16和HPV18导致）方面可以提供相当的免疫原性和保护效力，根据现有的条件，接种三种HPV疫苗中任何一种，都是可以的。



按照九价HPV疫苗说明书，如果有人接种完3剂四价HPV疫苗，还想接种九价HPV疫苗，则至少间隔12个月后才能接种，且接种剂次为3剂。