下丘脑位于大脑基底部，是GnRH的合成部位，其分泌不足时通过影响垂体和卵巢而导致闭经，如生理性闭经中的青春期前、妊娠期和哺乳期均是下丘脑性闭经。而常见的导致病理性闭经的原因包括：



1．基因缺陷：原发性GnRH缺乏，如果患者伴有嗅觉障碍，则为Kallmann综合征；若不伴嗅觉障碍，多诊断为特发性低促性腺激素功能低下。



2．器质性：畸形、肿瘤、损伤。



3．功能性：神经性厌食、运动性闭经、应激性闭经、营养相关性闭经。



4．药物性闭经：如抗精神病、抗抑郁的药物等。



下丘脑性闭经时，生殖内分泌轴的司令部有了问题，就不能释放GnRH作用于垂体上，垂体得不到上级的指令，分泌的FSH、LH也是非常低的，而卵巢得不到指令，也处于瘫痪状态。所以下丘脑性闭经性激素也是FSH、LH、雌激素都非常低。



其中由于垂体性闭经和下丘脑性闭经FSH、LH、E2均低，我们也可以将其合并，统称为中枢性闭经，但是其中有一特殊类型，即FSH、LH可以在正常范围，但是E2很低，有的专家称之为非高促性腺激素性闭经。