单纯肾囊肿的原因尚不完全清楚。肾小管（收集尿液的肾脏内的微小结构）的阻塞或肾脏血液供应不足可能起到一定作用。肾小管上形成的憩室囊可能分离并变成单纯性肾囊肿。尚未有研究揭示遗传因素在单纯肾囊肿生成中的作用。

单纯性肾囊肿通常不会引起症状或造成肾脏损害。然而，在某些情况下，当囊肿变大并压迫其他器官时，肋骨和臀部之间会出现疼痛。有时囊肿会被感染，引起发烧，疼痛和压痛。

通常认为单纯性肾囊肿不会影响肾功能，但一项研究发现囊肿的存在与60岁以下住院患者的肾功能下降之间存在关联。

一些研究发现单纯性肾囊肿与高血压之间存在关联。例如，在移除较大的囊肿后，一些人的高血压会有所改善。但是，这种关系还不是太明确。

诊断方法:

超声。超声波使用一种叫做传感器的装置，会将安全、无痛的声波从器官上反弹回来，构建出这些器官结构的图像。腹部超声可以构建整个泌尿道的图像。超声图像可用于鉴别诊断无害的囊肿和其他疾病。

计算机断层扫描（computerizedtomography，CT）扫描。CT扫描使用X射线和计算机技术的组合来创建三维（3D）图像。CT扫描可能会会包含注射称为造影剂的特殊染料。CT扫描需要受试者躺在工作台上，该工作台滑入隧道形设备并拍摄X射线。CT扫描可以显示肾脏中的囊肿和肿瘤。

MRI检查。

MRI设备在不使用X射线的情况下，使用无线电波和磁场生成身体内部器官和软组织的详细图片。MRI可能会包含注射造影剂。对于大多数MRI机器来说，受试者躺在工作台上，工作台滑入隧道形装置，该装置可以是开口的或者一端封闭的;一些较新的机器的设计可以让受试者躺在更加开放的空间。像CT扫描一样，MRI可以显示囊肿和肿瘤。

对于没有任何症状的单纯性肾囊肿，不需要治疗。可以隔一段时间用超声监测单纯性肾囊肿的情况。

出现肾脏症状或阻止血液或尿液流动的单纯性肾囊肿就可能需要使用称为硬化疗法的手术进行治疗。在硬化疗法中，医生使用长针穿过皮肤刺破囊肿。超声用于引导针头到囊肿所在的位置。引流囊肿然后用含有酒精的溶液填充以使肾组织变硬。该手术通常使用局部麻醉的方法在门诊手术室中进行。

如果囊肿很大，可能需要手术治疗。大多数手术都可以通过腹腔镜进行，腹腔镜是一种带有小型照明摄像机的特殊工具。该手术通常需在全身麻醉的情况下在医院进行。外科医生引流囊肿，然后去除或烧掉其外层组织。这种类型的手术使得病人的切口更小和恢复更快。