不规范抗结核治疗容易导致停药后复发，包括治疗方案不规范，反复停药，疗程不够等。

经过规范的抗结核治疗，不到5%的患者可能会复发，且主要集中在治愈停药2年内。导致复发的因素主要是机体免疫功能下降导致体内残留的休眠结核菌再次活动。这些因素包括慢性疾病尤其是糖尿病，风湿性疾病，免疫抑制剂使用等，过度劳累，睡眠不足，营养不良等也是高危因素。因此治愈停药后建议在第3，第6，第12，第24个月复查监测肺结核有无复发。少部分患者可能重新感染结核菌后再次发病，不能认为是复发。

积极治疗控制慢性病如糖尿病，改善营养状况，保持充足睡眠及适当锻炼有助于提高免疫力，降低结核病复发或者重新感染发生结核病的风险。