当非手术治疗无法缓解肩峰撞击症的疼痛时，需要考虑关节镜微创手术。

手术的目的是为肩袖创造更多的空间。为此，运动医学大夫将去除发炎的肩峰下滑囊。同时需要用微创磨头去除肩峰骨刺，这也被称为肩峰下减压。所有这些过程都可以使用关节镜微创技术（key hole surgery）进行。

在关节镜手术中，将微型镜头和手术器械置入肩关节周围的2-3个微创切口中。外科医生通过连接到电视摄像机的光纤瞄准镜检查肩关节，在直接监视下去除骨刺和滑囊。与此同时，关节镜还可以同时治疗肩部其他疾病。包括肩锁关节骨关节炎，二头肌腱炎或肩袖撕裂。

康复锻炼。手术后早期，上肢需要用肩肘吊带保护。这样可以减轻疼痛，有利于早日康复。当急性疼痛期结束，可以去除吊带，开始锻炼肩关节和手臂。

物理治疗师将根据个体需求和手术结果提供康复计划。这将包括恢复肩关节的运动范围的锻炼和肌肉力量的训练。术后通常需要2到4个月才能完全缓解疼痛，少数人可能需要长达一年的时间。