2000年，中华医学会专家、重庆医科大学附属儿童医院儿保科主任黎海芪教授曾组织过流行病学调查：我国婴儿蛋白质过敏发生率为6.1%。随着岁月的变迁，可能是环境恶化等方面的原因，蛋白质过敏的发病率越来越高。现在，虽然没有做过正式的调查，但多年来对过敏的研究来看，20%左右的宝宝可能存在蛋白质过敏。
蛋白质过敏很让人难过啊！蛋白质是宝宝必需的重要营养，宝宝居然对蛋白质过敏，您说难不难过？
乳糖不耐受也有愈演愈烈的趋势。估计也有20%的宝宝对乳糖不耐受。
乳糖是上天专门为宝宝诞生的专用营养（存在于乳汁当中），宝宝居然对乳糖不耐受，真是无语了。
蛋白质过敏与乳糖不耐受有什么区别呢？
蛋白质过敏属于免疫系统的问题。蛋白质被宝宝吃进去之后，在消化道内消化成氨基酸（这个过程叫“水解”），然后由宝宝吸收氨基酸。宝宝吸收的是氨基酸，不是蛋白质。对蛋白质过敏的宝宝，是因为蛋白质还没有完全被消化成氨基酸就被宝宝吸收进血液了，即，宝宝直接吸收了蛋白质，或者吸收了由蛋白质到氨基酸过程中的中间体（肽链，蛋白质先水解成肽链，再由肽链水解成氨基酸）。只要是吸收了蛋白质或者肽链，不管是大人还是小孩，都会过敏，医学上这叫做“异种蛋白”过敏。
乳糖不耐受属于消化系统问题。正常的情况下，宝宝吃进乳糖，是在乳糖酶的作用下把乳糖消化成葡萄糖和半乳糖，宝宝吸收的是葡萄糖和半乳糖。对乳糖不耐受的宝宝，是乳糖吃进去之后，肠道内乳糖酶不足，无法完全将乳糖分解，也不吸收乳糖，乳糖在肠道内积蓄，部分乳糖为肠道内的细菌提供营养，被肠道内细菌利用，酵解成乳酸、氢气、甲烷和二氧化碳。乳酸刺激肠壁，增加肠蠕动而出现腹泻。二氧化碳在肠道内产生胀气，偶尔诱发肠痉挛出现肠绞痛。
也就是说：蛋白质过敏，是蛋白质（或肽链）进入了血液，引起免疫反应；乳糖不耐受是乳糖不分解，乳糖未进入血液，而呆在肠道内引起不良反应。
蛋白质过敏可引起宝宝全身一处或多处反应：
消化道症状：腹泻、便秘、腹痛、呕吐、拒食、反流、直肠出血、生长发育迟缓等。
皮肤症状：荨麻疹、湿疹、皮疹、瘙痒、干燥、水肿等。
呼吸道症状：咳嗽、喘息、哮喘、鼻炎等。
口腔症状：口腔过敏综合征：咽/唇/舌的水肿/瘙痒等。
全身症状：急性过敏综合征，如休克等，这种情况很少见。
乳糖不耐受一般是引起宝宝消化道方面的不适，如腹泻、腹胀、肠鸣、多屁等。
比如：如果是湿疹（皮肤症状）、喘息（呼吸道症状）、嘴唇肿起（口腔症状），在这两种疾病当中鉴别的话，一般是属于蛋白质过敏，而不属于乳糖不耐受。
如果只是拉肚子，则要进一步区别。比如，老是放屁的，可能属于乳糖不耐受。
有许多宝宝同时有这两种疾病：即对蛋白质过敏，又对乳糖不耐受。
对蛋白质过敏的宝宝，要吃完全水解或者深度水解蛋白奶粉。深度水解用于轻度（注意，必须确认是轻度）。建议从完全水解吃起，彻底杜绝过敏，情况好转了再逐渐转为深度水解奶粉，最终转为普通奶粉。
对乳糖不耐受的宝宝，可以吃不含乳糖的奶粉，宝宝肠道经过生长发育耐受乳糖了再转为普通奶粉。