该科创建于1962年，原称传染科，2004年改称感染科。现设肝病、肠道和发热三个门诊，主要诊治各类肝病、各类传染病及相关感染性疾病。该科为平阳县传染病临床救治定点单位，多年来在防治SARS、禽流感、麻疹、手足口病、甲型H1N1流感等重大传染病中成绩显著，受到县、市等上级部门的嘉奖和表扬。
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